IAEA事務所は1984年5月、当初「IAEA東京事務所」として、日本とIAEAの保障措置協定の実施促進を主な目的に設置されました。その後1989年12月に、地域全体でIAEAを代表するという役割の拡大を受け、「東京地域事務所（TRO）」へと改称されました。

事務所の主な機能は以下のとおりです。

• 日本国内でIAEAを代表する拠点としての役割を果たす。
• 日本政府担当者や国の関係機関との迅速な連絡を確保する。
• 定期的査察をスムーズに行えるよう、駐在・派遣査察官を支援するとともに、日本その他の地域諸国での抜き打ち的査察や、査察開始間際のスケジュール変更に対応する。
• 保障措置関連の査察に必要な技術的、事務的作業を効果的に遂行できるよう、作業事務所を提供する。
• 保障措置に関連する各種機材の保守と修理を行える施設を備えた保管・輸送拠点を提供する。
• 六ヶ所再処理工場オンサイト分析所（OSL）で日常的業務を行う駐在分析官を提供する。

東京地域事務所とウィーン本部のIAEA査察官は、文部科学省科学技術・学術政策局原子力安全課保障措置室のカウンターパートと密接に協力し、もっとも効果的かつ効率的に保障措置を遂行しています。